Öğretim Görevlisi Dr. Ömer Faruk BAY
Dr. Ömer Faruk Bay, Türkiye’de Atatürk Üniversitesi’nden Moleküler Biyoloji ve Genetik alanında lisans derecesine sahip olup, Birleşik Krallık'taki Manchester Üniversitesi’nde Sistem Biyolojisi ve Biyoinformatik alanında yüksek lisans ve Biyoinformatik alanında doktora derecelerini almıştır. Doktora araştırmasında Trichuris muris metabolizmasını incelemiş ve bu parazit kamçı kurdu için ilk genom ölçekli metabolik modeli geliştirmiştir. Bu modeli kullanarak daha etkili tedavi stratejileri için yeni terapötik hedefler geliştirmiştir. Sonrasında genom ölçekli metabolik modeller kullanarak bağırsak mikrobiyotasındaki etkileşimleri çalışmak için RWTH Aachen Üniversitesi’nde Hesaplamalı Biyotıp Enstitüsü’ne katılmıştır. Dr. Bay burada öncelikli olarak Oligo Mouse Microbiota 19 (OMM19) olarak bilinen sentetik fare bağırsak bakteri topluluğu için genom ölçekli metabolik modellerin geliştirilmesine odaklanmıştır. Bu bakterilerin metabolik yeteneklerini ve etkileşimlerini derinlemesine inceleyerek, topluluklarının fenotipini ve kompozisyonun bozulmasına karşı dayanıklılığını çalışmıştır. 2024 yılında Abdullah Gül Üniversitesi’ne Doktor Öğretim Görevlisi olarak atanan Dr. Bay, bundan sonraki çalışmalarında genom ölçekli metabolik modeller kullanarak konak-mikrobiyota, konak-patojen metabolik ilişkilerinin anlaşılmasına ve kamçı kurduna karşı etkili ilaç geliştirilmesine yoğunlaşmayı amaçlamaktadır.
Yayınlar
Bay, Ö.F., Hayes, K.S., Schwartz, JM. et al. A genome-scale metabolic model of parasitic whipworm. Nat Commun 14, 6937 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-42552-4.